2026年2月12日木曜日

たんぱく質のフォールディングを計算してみた

たんぱく質の構造計算ってなんでこんなにめんどくさいんだ。

geminiのproモードで3日間、朝から晩までソースコード作成の質問を投げ続け、ついにたんぱく質の構造計算プログラムが完成しました。

このカルモジュリンってたんぱく質の計算がめっちゃくちゃ難しい。

昨日までは1粒子モデルだったんですが、どうしてもカルモジュリンが計算できなくて2粒子モデルにしました。

シャペロンの助けがなくてダンベルに折りたたまれないといけないので、めっちゃくちゃ大変でした。

でもなんかあってそうな気がする。

次はコラーゲンの螺旋の計算が正しくできるように3粒子モデル?



Calmodulin

Prepro-oxytocin
 


ソースコードはこちら

https://github.com/yomei-o/protain_test



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